崇祯六年，山西出现瘟疫。崇祯「七年八年，兴县盗贼杀伤人民，岁馑日甚。天行瘟疫，朝发夕Si。至一夜之内，百姓惊逃，城为之空」。
崇祯八年1635年，总兵龙世威统兵防守潼关、朱yAn关等隘口，「露宿凡十旬，皆患疫疠不能军，闯贼大至，遂溃。」[15]
崇祯十年1637年以後，山西全境瘟疫大流行「瘟疫盛作，Si者过半」，疫情传到河南地区，「瘟疫大作，Si者十九，灭绝者无数」。榆林府「大瘟，……米脂城中Si者枕藉，十三年，夏又大疫，十五年，……大疫，十六年，稔，七月郡城瘟疫大作」。
崇祯十二年夏，商洛山中瘟疫流行，李自成、刘宗敏的义军将士染病。
崇祯十三年，顺德府今邢台、河间府今河间和大名府今大名有大疫，人Si。
崇祯十六年二月，北京大疫，病名叫「疙瘩病」，「大疫，人鬼错杂。薄暮人屏不行。贸易者多得纸钱，置水投之，有声则钱，无声则纸。甚至白日成阵，墙上及屋脊行走，揶揄居人。每夜则痛哭咆哮，闻有声而逐有影」。[16]
崇祯十六年八月，天津爆发肺鼠疫：「上天降灾，瘟疫流行，自八月至今九月十五日，传染至盛。有一二日亡者，有朝染夕亡者，日每不下数百人，甚有全家全亡不留一人者，排门逐户，无一保全。」[17]
崇祯十七年，天津督理军务骆养X说，「昨年京师瘟疫大作，Si亡枕藉，十室九空，甚至户丁尽绝，无人收敛者。」
清朝
咸丰五年1855年六月，清水大疫。六年五月，咸宁大疫。十一年春，即墨大疫。六月，h县大疫。[18]
俞樾的《曲园笔记》记载，「同治之初，滇中大乱，贼所到之处，杀人如麻，白骨飞野；通都大邑，悉成坵墟。乱定之後，孓遗之民，稍稍复集，扫除胔骼；经营苫盖。时则又有大疫，疫之将作，其家之鼠，无故自毙，……人不及见，久而腐烂，人闻其臭，鲜不疾者，病皆骤然而起，……或逾日Si，或即日Si，诸医束手，不能处方；……其得活者，千百中一二而已。疫起乡间，延及城市，一家有病者，则其左右十数家即迁移避之，踣於道者无算，然卒不能免也。甚至阖门同尽，b户皆空，小村聚中，绝无人迹……」
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